Bireylerin sisteme katılmaları dolayısıyla uygulanacak vergi uygulamalarını üçe ayırabiliriz:

Şirketimize ödeyeceğiniz katkı payları, vergi matrahlarının tespitinde indirim konusu yapıldığı için daha az vergi ödersiniz. Ancak, indirim yapılabilecek tutarın tespitinde iki sınıra dikkat edilmelidir:

• Vergiye tabi ücret matrahının tespitinde Bireysel Emeklilik Sistemi'ne ödenen katkı payının katılımcının aylık brüt ücretinin %10'una kadar olan kısmı indirim konusu yapılabilecektir.
  
  
• Bir takvim yılı içerisinde Bireysel Emeklilik ile ilgili olarak yapılabilecek indirim tutarı brüt asgari ücretin yıllık tutarını aşmayacaktır

Katkı paylarının değerlendirileceği emeklilik fonlarının tüm kazançları kurumlar ve gelir vergisinden muaftır.

Uzun vadeli sistemde kalışlarda en düşük oranda vergi uygulaması ile katılımcılar desteklenmektedir. Bu nedenle üç aşamalı bir yapı belirlenmiştir:

• Emekliliğe hak kazandıysanız (10 yıl sistemde kalıp, 56 yaşını doldurursanız) gelirleri ile birlikte tüm birikimlerinizin %75'i üzerinden %5 vergi ödersiniz. Yani %3,75 vergi ödeyerek sistemden çıkabilirsiniz. Gelirleri ile birlikte tüm birikimlerinizin %25'i vergiden muaf olur.
  
  
• 10 yıl sistemde bulunup 56 yaşını doldurmadan sitemden ayrılırsanız gelirleri ile birlikte tüm birikimleriniz üzerinden %10 vergi ödeyerek sistemden ayrılabilirsiniz.
  
  
• 10 yıl dolmadan ayrılırsanız gelirleri ile birlikte tüm birikimleriniz üzerinden %15 vergi ödeyerek sistemden ayrılırsınız.